Predhodni postopek: postopek predhodne presoje, v katerem se ugotovi, ali bo treba za posamezen poseg izvesti presojo vplivov na okolje in pridobiti okoljevarstveno soglasje. Izvede se le za posege v okolje, pri katerih se zaradi značilnosti nameravanega posega ali njihove lokacije lahko pričakujejo pomembni vplivi na okolje, ki jih določa Uredba.
Po prejemu popolne zahteve, zagotovitvi vpogleda javnosti z javnim naznanilom na spletnih straneh državne uprave, Ministrstvo za okolje in prostor izda odločbo o ugotovitvi, ali je za nameravan poseg treba izvesti presojo vplivov na okolje in pridobiti okoljevarstveno soglasje. Nevladna organizacija in civilna iniciativa imata položaj stranskega udeleženca v postopku, če sta vložili zahtevo za vstop v postopek v 30 dneh od objave. Zagotoviti morata varen elektronski predal, kamor bo ministrstvo vročalo dokumente.

Informacija o obsegu in vsebini poročila o vplivih nameravanega posega na okolje: nosilec nameravanega posega, ki mora pred začetkom izvajanja posega, ki lahko pomembno vpliva na okolje, pridobiti okoljevarstveno soglasje ministrstva ali integralno gradbeno dovoljenje v skladu z zakonom, ki ureja graditev, lahko pred začetkom postopka presoje vplivov na okolje od ministrstva zahteva informacijo o obsegu in vsebini poročila o vplivih nameravanega posega na okolje. Predložiti mora idejno zasnovo za pridobitev projektnih in drugih pogojev nameravanega posega po predpisih o graditvi objektov, če gre za gradnjo, ali podatke o njegovi namembnosti in bistvenih značilnostih, če ne gre za gradnjo. Lahko zahteva tudi ustno predstavitev idejne zasnove nameravanega posega ali njegovih bistvenih značilnostih ministrstvu. Ministrstvo dokumentacijo pošlje ministrstvom in drugim organizacijam, ki so glede na nameravani poseg pristojne za posamezne zadeve varstva okolja, naravo ali varstvo ali rabo naravnih dobrin, za varstvo kulturne dediščine, varstvo krajine ali varstvo zdravja ljudi, da se izrečejo o tem, katere podatke naj vsebuje poročilo, da bodo lahko dale mnenje o vplivih nameravanega posega na okolje s stališča svoje pristojnosti. Ministrstvo pripravi pisno informacijo, ki vključuje vse informacije, ki jih je za pripravo poročila smiselno zahtevati, ter jo posreduje nosilcu nameravanega posega.

Integralni postopek: če je objekt, za katerega je predpisana pridobitev gradbenega dovoljenja, objekt z vplivi na okolje, se postopek izdaje gradbenega dovoljenja in postopek presoje vplivov na okolje, združita (integralni postopek), gradbeno dovoljenje pa izda Ministrstvo za okolje in prostor. Agencija za okolje je v integralnem postopku mnenjedajalec.

Opis postopka pridobitve okoljevarstvenega soglasja:

Postopek za izdajo okoljevarstvenega soglasja za posege, ki niso gradnja, se na Ministrstvu za okolje in prostor začne na zahtevo nosilca nameravanega posega, ki zanj zaprosi z vlogo, ki ji morata biti priložena poročilo o vplivih na okolje in projekt nameravanega posega, ki vsebuje bistvene značilnosti o posegu. Poročilo mora biti izdelano v skladu z Uredbo o vsebini poročila o vplivih nameravanega posega na okolje in načinu njegove priprave.

V postopku izdaje okoljevarstvenega soglasja se v primeru posega v naravo z vplivi na okolje, ne glede na to, ali je vpliv samo daljinski ali tudi neposreden, izvede presoja sprejemljivosti, skladno z določili Pravilnika o presoji sprejemljivosti vplivov izvedbe planov in posegov v naravo na varovana območja. Poročilo o vplivih na okolje mora v tem primeru vsebovati tudi dodatek za presojo sprejemljivosti posega v naravo, ki mora biti pripravljen na način in v obsegu, kot ga določa navedeni Pravilnik o presoji sprejemljivosti vplivov izvedbe planov in posegov v naravo na varovana območja. V takem primeru se z izdajo okoljevarstvenega soglasja šteje, da je izdano tudi naravovarstveno soglasje.

Ministrstvo formalno popolno vlogo pošlje občini, na območju katere bo izveden nameravani poseg, da se opredeli glede skladnosti z občinskimi prostorskimi izvedbenimi akti, ter ministrstvom in organizacijam. Nato jih pozove, naj se opredelijo, ali je nameravani poseg v okolje sprejemljiv. Če je poseg sprejemljiv, projekt in poročilo o vplivih na okolje pa ustrezna, pripravi osnutek okoljevarstvenega soglasja in nadaljuje postopek.

Ministrstvo po tem obvesti javnost o začetem postopku presoje vplivov nameravanega posega v okolje. Z javnim naznanilom na krajevno običajen način in z objavo na osrednjem spletnem mestu državne uprave obvesti javnost, da je za nameravani poseg v okolje potrebna presoja vplivov na okolje in omogoči vpogled javnosti v vlogo za pridobitev okoljevarstvenega soglasja, projekt, poročilo o vplivih na okolje, mnenja in osnutek okoljevarstvenega soglasja. Po prejemu mnenj, predlogov in pripomb ministrstvo seznani nosilca nameravanega posega ter izvede javno obravnavo, na katero povabi zainteresirano javnost, ki je v okviru javne razgrnitve posredovala mnenja, pripombe in predloge, in nosilca nameravanega posega. Na podlagi izvedene javne obravnave ministrstvo pozove nosilca nameravanega posega, da se do mnenj, predlogov in pripomb zainteresirane javnosti pisno opredeli ter po potrebi dopolni poročilo o vplivih na okolje s predlaganimi ukrepi za preprečevanje in odpravo ali zmanjševanje pomembnih škodljivih vplivov na okolje ali za njihovo izravnavo, ki jih je podala zainteresirana javnost.

Če bi nameravani poseg lahko pomembno vplival na okolje v državi članici, ministrstvo najkasneje hkrati z javnim naznanilom pošlje pristojnemu organu te države obvestilo o nameravanem posegu in razpoložljive podatke o njegovih možnih čezmejnih vplivih na okolje.

Ministrstvo odloči o okoljevarstvenem soglasju in izda okoljevarstveno soglasje v treh mesecih po prejemu popolne vloge, v katerega ni štet 15-dnevni rok za izdajo ponovnega mnenja mnenjedajalcev, s katerim se spremeni poročilo o vplivih na okolje ali projekt nameravanega posega v okolje. Rok za izdajo odločbe ne teče v času javne razgrnitve.

Nosilec nameravanega posega lahko izvede poseg le na podlagi pravnomočnega okoljevarstvenega soglasja oziroma integralnega gradbenega dovoljenja, začetek izvedbe posega pa mora prijaviti pristojni inšpekciji.

Zoper odločbo ni pritožbe, dopusten pa je upravni spor.